La misión principal de la Secretaría Académica es garantizar la gestión académica dentro de la U.A., debiendo planificar y ejecutar acciones que repercutan positivamente en los procesos educativos de las diferentes carreras que se dictan en la U.A., con el objetivo final de lograr excelencia académica en las mismas.
La secretaría académica tiene un rol activo en la definición, ejecución y seguimiento de las políticas académicas de la Facultad, debiendo interactuar entre los departamentos de Carrera, los docentes, los alumnos y las otras secretarias de la U.A.